Différents syndromes de microangiopathies thrombotiques ont été notés dans la suite de la prise de nombreux médicaments.

D'authentiques PTT acquis ont été décrits, mais le plus souvent le tableau clinique ressemble plus à un SHU avec une atteinte rénale prédominante

Différents médicaments utilisés en cancérologie peuvent déclencher un syndrome de MAT, comme la mitomycine C, la gemcitabine et les antagonistes du VEGF (vascular-endothelial growth factor). La mitomycine C est le plus classique d’entre eux, bien que son utilisation soit actuellement plus rare. La fréquence de survenue d’une MAT après traitement par mitomycine C varie de moins de 2 à 10 p. 100 et paraît dose-dépendante. Le mécanisme physiopathologique des MAT chez les patients recevant une chimiothérapie reste imprécis, mais il semble, là encore, impliquer une souffrance endothéliale. Le syndrome de MAT après administration de mitomycine C est caractérisé par une hypertension artérielle et un œdème pulmonaire lésionnel. À l’opposé, les troubles neurologiques et la fièvre sont rarement présents. La prise en charge comprend l’arrêt total et définitif du médicament et la réalisation d’échanges plasmatiques. Le pronostic est généralement péjoratif

D’authentiques PTT, associés à un déficit sévère en ADAMTS13 lié à des anticorps anti-ADAMTS13, ont été décrits chez des patients traités par ticlopidine. Ces anticorps inhibent ADAMTS13 indépendamment du médicament, ce qui suggère que ce sont des autoanticorps et non des anticorps immuno-allergiques. Une étude a par ailleurs rapporté l’effet cytotoxique de la ticlopidine sur l’endothélium, qui aboutit à un processus d’apoptose. Le pronostic est en règle bon sous échanges plasmatiques. Le clopidogrel peut s'associer à des MAT caractérisées par une insuffisance rénale, une activité ADAMTS13 détectable ou normale, et une réponse médiocre aux échanges plasmatiques. Les autres médicaments pouvant déclencher un syndrome de MAT sont les œstroprogestatifs, la quinine, l’immunotoxine anti-CD22 et l’interféron-alpha.

Pour certains médicaments le lien de causalité ne fait pas de doute, alors que pour d'autre, il est plus difficile d'affirmer que seul le médicament ait pu déclencher la MAT. Pour complexifier les choses, certains médicaments potentiellement inducteur de MAT, peuvent être utilisés dans la prise en charge des patient (par exemple la ciclosporine ou le clopidogrel).

Enfin, des MAT ont été décrites chez des cocaïnomanes.